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Il y a plus de 350 000 ans, l'homme de Néandertal dominait le monde grâce à son savoir-faire, ses croyances et sa culture. Puis ... il a disparu il y a 30 000 ans. Génocide, épidémie, changement climatique, consanguinité ou dilution génétique : toutes les hypothèses ont été étudiées afin de comprendre l'anéantissement de cette espèce humaine. Pour résoudre cette énigme, le film s'appuie sur une enquête scientifique internationale et sur des images cinématographiques extraites du film « AO, le dernier Néandertal », de Jacques Malterre.